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UTF-8-MAC問題
(UTF-8)
バ (UTF-8-MAC)

同じ文字でもMACのファイル名とかでは特殊なUTF-8になるらしい(知らなかった)。
そしてScrapboxはその2つを区別してるっぽいので、上記のように同じ文字でも2つの別々のページになってしまう。

解決案
saveする前に文字コードをUTF-8に一律で変換するなど