"I didn’t mean it." という表現に "that way" を省略すると、その意味が少し広がります。

"I didn’t mean it that way.この言葉は特定の意味合いや文脈で言ったことが誤解されたときに使われます。「そのように」という言葉が指すのは、相手がどのように理解したかという具体的な方法や解釈です。

"I didn’t mean it."この表現はもう少し一般的で、言ったこと全体が意図しなかったこと、あるいは言うべきでなかったことを示しています。この場合、「何を言ったか」ではなく、「そもそも言うべきではなかった」という意味に近いです。

つまり、「that way」を省くことで、その発言自体が間違いだったか、あるいは言わない方がよかったかのような印象を与えることがあります。