Scrapboxのimportのoverwritten(上書き)の仕様
importすると一部のページが消えることもあるのでは?という不安はある
個人的に実験したところ、タイトルがかぶっているページに関しては……
上書きにチェックすると、これからimportするページが優先されて、まるっと上書きされてしまう(

追記ではないので注意!)
上書きにチェックしなければ、これからimportしようとしているページが消える(importされない)
当たり前だが、元のjsonファイルは消えない
目視でダブるページを確認して、jsonファイルのそれらのタイトルをいじれば上書きされなくなるだろう
もっと賢い方法がありそうだが……